Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd5Q3V1H9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Samd5Q3V1H9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms