Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms