Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930567H17RikQ3V0K5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms