Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp48Q3V0C5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms