Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms