Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Skap1Q3UUV5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms