Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thsd4Q3UTY6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thsd4Q3UTY6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms