Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms