Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf48Q3US17 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf48Q3US17 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf48Q3US17 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf48Q3US17 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf48Q3US17 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf48Q3US17 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf48Q3US17 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf48Q3US17 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms