Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rtl4Q3URY0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms