Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acsf3Q3URE1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsf3Q3URE1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsf3Q3URE1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsf3Q3URE1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsf3Q3URE1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsf3Q3URE1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsf3Q3URE1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsf3Q3URE1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acsf3Q3URE1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsf3Q3URE1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsf3Q3URE1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsf3Q3URE1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsf3Q3URE1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsf3Q3URE1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsf3Q3URE1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsf3Q3URE1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsf3Q3URE1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsf3Q3URE1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsf3Q3URE1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acsf3Q3URE1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms