Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Elf3Q3UPW2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms