Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa3Q3UPR0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms