Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UPC7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3UPC7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3UPC7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UPC7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UPC7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UPC7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3UPC7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3UPC7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q3UPC7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3UPC7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3UPC7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms