Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nhlrc4Q3UP44 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nhlrc4Q3UP44 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms