Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Skap2Q3UND0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms