Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Tmem253Q3UNB8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tmem253Q3UNB8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tmem253Q3UNB8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tmem253Q3UNB8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Tmem253Q3UNB8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem253Q3UNB8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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