Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cobll1Q3UMF0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cobll1Q3UMF0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms