Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ell2Q3UKU1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ell2Q3UKU1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ell2Q3UKU1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ell2Q3UKU1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ell2Q3UKU1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ell2Q3UKU1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ell2Q3UKU1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ell2Q3UKU1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ell2Q3UKU1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ell2Q3UKU1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ell2Q3UKU1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ell2Q3UKU1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ell2Q3UKU1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ell2Q3UKU1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms