Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcgf5Q3UK78 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcgf5Q3UK78 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms