Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc61Q3UJV1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms