Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp19Q3UJD6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms