Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cnep1r1Q3UJ81 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnep1r1Q3UJ81 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms