Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Greb1Q3UHK3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms