Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc177Q3UHB8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc177Q3UHB8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms