Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft2Q3UF64 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms