Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Yipf3Q3UDR8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Yipf3Q3UDR8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms