Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trafd1Q3UDK1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trafd1Q3UDK1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms