Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttll12Q3UDE2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms