Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LbrQ3U9G9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LbrQ3U9G9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.8 ms