Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kdm4dQ3U2K5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kdm4dQ3U2K5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms