Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U1D9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U1D9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Q3U1D9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U1D9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U1D9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U1D9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U1D9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Q3U1D9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U1D9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U1D9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U1D9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U1D9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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