Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmd1Q3TXS7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmd1Q3TXS7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms