Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 632 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Gdpd4Q3TT99 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Gdpd4Q3TT99 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Gdpd4Q3TT99 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Gdpd4Q3TT99 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Gdpd4Q3TT99 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Gdpd4Q3TT99 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Gdpd4Q3TT99 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Gdpd4Q3TT99 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gdpd4Q3TT99 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Gdpd4Q3TT99 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Gdpd4Q3TT99 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Gdpd4Q3TT99 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Gdpd4Q3TT99 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd4Q3TT99 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms