Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CiartQ3TQ03 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CiartQ3TQ03 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms