Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc102aQ3TMW1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc102aQ3TMW1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms