Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp39Q3TIX9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms