Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RubcnlQ3TD16 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms