Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc69Q3TCJ8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms