Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC93

Hs1bp3, HCLS1-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs1bp3Q3TC93 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hs1bp3Q3TC93 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hs1bp3Q3TC93 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hs1bp3Q3TC93 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hs1bp3Q3TC93 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hs1bp3Q3TC93 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hs1bp3Q3TC93 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hs1bp3Q3TC93 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hs1bp3Q3TC93 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hs1bp3Q3TC93 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hs1bp3Q3TC93 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hs1bp3Q3TC93 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms