Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm3Q32NY4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnnm3Q32NY4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms