Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN4

Defb30, Beta-defensin 30, mousemouse

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Length 75 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb30Q30KN4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Defb30Q30KN4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb30Q30KN4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Defb30Q30KN4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb30Q30KN4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb30Q30KN4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb30Q30KN4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Defb30Q30KN4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Defb30Q30KN4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Defb30Q30KN4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Defb30Q30KN4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Defb30Q30KN4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Defb30Q30KN4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Defb30Q30KN4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Defb30Q30KN4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Defb30Q30KN4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Defb30Q30KN4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Defb30Q30KN4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Defb30Q30KN4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb30Q30KN4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Defb30Q30KN4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms