Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN3

Defb33, Beta-defensin 33, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb33Q30KN3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Defb33Q30KN3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Defb33Q30KN3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Defb33Q30KN3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Defb33Q30KN3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Defb33Q30KN3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Defb33Q30KN3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Defb33Q30KN3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defb33Q30KN3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Defb33Q30KN3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Defb33Q30KN3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Defb33Q30KN3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Defb33Q30KN3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Defb33Q30KN3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Defb33Q30KN3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Defb33Q30KN3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb33Q30KN3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms