Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna5Q2MKA5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms