Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Samd11Q1RNF8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd11Q1RNF8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms