Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm1123Q1RME4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm1123Q1RME4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms