Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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