Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tdrd9Q14BI7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tdrd9Q14BI7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms