Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ptchd1Q14B62 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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ptchd1Q14B62 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ptchd1Q14B62 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ptchd1Q14B62 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ptchd1Q14B62 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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ptchd1Q14B62 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ptchd1Q14B62 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ptchd1Q14B62 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ptchd1Q14B62 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ptchd1Q14B62 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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ptchd1Q14B62 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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