Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rpusd3Q14AI6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rpusd3Q14AI6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rpusd3Q14AI6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rpusd3Q14AI6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rpusd3Q14AI6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rpusd3Q14AI6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd3Q14AI6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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